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LNCRNA测序

产品概述

长链非编码RNA(IncRNA)是一类长度在200bp以上的非编码RNA,最初被认为是不具备生物学功能的转录副产物,但近期研究表明IncRNA通过与DNA/RNA/蛋白质结合,在表观遗传、转录及转录后等水平调控基因表达,参与多种生物学过程,尤其在肿瘤当中发挥了重要的调控功能。IncRNA测序研究特定时空条件下的IncRNA和mRNA,是转录调控研究的重要手段。


技术路线



重要参数指标

样品要求


样品类型:新鲜组织、细胞、FFPE

样本总量:total RNA总量不低于6μg

样品质量:无明显降解,浓度不低于100ng/μL

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测序策略 PE150bp

数据量 8G/10G




案例分析

心衰是影响人类健康的重大心血管疾病之一,心肌细胞mRNA与miRNA表达特征变化与心血管疾病发生的关系已有众多报道,尽管很多研究表明IncRNA与多种疾病发生都有紧密关系,人心肌细胞中IncRNA表达研究却未见报道。本研究通过对缺血型、非缺血型pre和post-LVAD样本以及正常LV样本进行高通量测序,发现IncRNA可以用于区分缺血型和非缺血型起源的心肌症。

图一、lncRNA能够区分failing和non-failing LV 样本


图二、 lncRNA能区分安装机械辅助循环装置前后HF样本

Kai-Chien Yang, et al. Deep RNA Sequencing Reveals Dynamic Regulation of Myocardial Noncoding RNA in Failing Human Heart and Remodeling with Mechanical Circulatory Support. Circulation, 2014




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